MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-9

Total Repeats: 784

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000954	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000954	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	11497348
3	NC_000954	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	11497348
4	NC_000954	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	11497348
5	NC_000954	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497348
6	NC_000954	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497348
7	NC_000954	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497348
8	NC_000954	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497348
9	NC_000954	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	11497348
10	NC_000954	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	11497348
11	NC_000954	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11497348
12	NC_000954	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	11497348
13	NC_000954	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497348
14	NC_000954	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497348
15	NC_000954	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497348
16	NC_000954	AAT	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497348
17	NC_000954	TCT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497348
18	NC_000954	T	6	6	752	757	0 %	100 %	0 %	0 %	11497348
19	NC_000954	AAT	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497348
20	NC_000954	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497348
21	NC_000954	ATTA	2	8	947	954	50 %	50 %	0 %	0 %	11497348
22	NC_000954	TGG	2	6	1028	1033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497348
23	NC_000954	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497348
24	NC_000954	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497348
25	NC_000954	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497348
26	NC_000954	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497348
27	NC_000954	AGA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497349
28	NC_000954	AGA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497349
29	NC_000954	AGA	2	6	1353	1358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497349
30	NC_000954	GCA	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497349
31	NC_000954	AGCA	2	8	1427	1434	50 %	0 %	25 %	25 %	11497349
32	NC_000954	AG	3	6	1509	1514	50 %	0 %	50 %	0 %	11497349
33	NC_000954	ATT	2	6	1533	1538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497349
34	NC_000954	AGG	2	6	1607	1612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497349
35	NC_000954	TTGC	2	8	1615	1622	0 %	50 %	25 %	25 %	11497349
36	NC_000954	GTTC	2	8	1680	1687	0 %	50 %	25 %	25 %	11497349
37	NC_000954	GA	3	6	1742	1747	50 %	0 %	50 %	0 %	11497349
38	NC_000954	ATTAA	2	10	1783	1792	60 %	40 %	0 %	0 %	11497349
39	NC_000954	TCT	2	6	1816	1821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497349
40	NC_000954	TTG	2	6	1844	1849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497349
41	NC_000954	AGA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497349
42	NC_000954	GA	3	6	1861	1866	50 %	0 %	50 %	0 %	11497349
43	NC_000954	AGA	2	6	2039	2044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497350
44	NC_000954	A	6	6	2052	2057	100 %	0 %	0 %	0 %	11497350
45	NC_000954	TAG	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497350
46	NC_000954	ACA	2	6	2259	2264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497350
47	NC_000954	TGG	3	9	2282	2290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497350
48	NC_000954	TGGCA	2	10	2333	2342	20 %	20 %	40 %	20 %	11497350
49	NC_000954	TGCT	2	8	2536	2543	0 %	50 %	25 %	25 %	11497350
50	NC_000954	AATTA	2	10	2574	2583	60 %	40 %	0 %	0 %	11497350
51	NC_000954	CAAG	2	8	2685	2692	50 %	0 %	25 %	25 %	11497351
52	NC_000954	GAA	2	6	2700	2705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497351
53	NC_000954	A	6	6	2769	2774	100 %	0 %	0 %	0 %	11497351
54	NC_000954	TAG	2	6	2813	2818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497351
55	NC_000954	GTT	2	6	2827	2832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497351
56	NC_000954	AGA	2	6	2897	2902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497351
57	NC_000954	TA	3	6	2972	2977	50 %	50 %	0 %	0 %	11497351
58	NC_000954	CTGATA	2	12	2992	3003	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497351
59	NC_000954	ATGT	2	8	3022	3029	25 %	50 %	25 %	0 %	11497351
60	NC_000954	TAG	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497351
61	NC_000954	GTAT	2	8	3047	3054	25 %	50 %	25 %	0 %	11497351
62	NC_000954	ATAA	2	8	3129	3136	75 %	25 %	0 %	0 %	11497351
63	NC_000954	TTA	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497351
64	NC_000954	TGG	3	9	3158	3166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497351
65	NC_000954	CCA	2	6	3168	3173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11497351
66	NC_000954	CT	3	6	3195	3200	0 %	50 %	0 %	50 %	11497351
67	NC_000954	CAAT	2	8	3211	3218	50 %	25 %	0 %	25 %	11497351
68	NC_000954	ATCAAG	2	12	3238	3249	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11497351
69	NC_000954	TGG	2	6	3341	3346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497351
70	NC_000954	ATT	2	6	3396	3401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000954	T	6	6	3511	3516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000954	ATC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_000954	TGG	3	9	3657	3665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000954	AAT	2	6	3736	3741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000954	TAG	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000954	TAA	2	6	3800	3805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000954	CAC	2	6	3835	3840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_000954	TTTA	2	8	3901	3908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000954	GTAA	2	8	3939	3946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000954	GGA	2	6	3963	3968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000954	ATT	2	6	3980	3985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000954	TGA	2	6	3986	3991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000954	ATT	2	6	3994	3999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000954	TAA	2	6	4298	4303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000954	TC	3	6	4318	4323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_000954	ATT	2	6	4350	4355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000954	TTA	2	6	4360	4365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000954	TTCAA	2	10	4391	4400	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_000954	A	6	6	4409	4414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000954	CTT	2	6	4446	4451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_000954	ATCA	2	8	4462	4469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_000954	AGA	2	6	4476	4481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000954	TAA	2	6	4494	4499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000954	A	6	6	4523	4528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000954	ATG	2	6	4579	4584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000954	TC	3	6	4606	4611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_000954	GCA	3	9	4630	4638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_000954	GCA	2	6	4645	4650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_000954	GGA	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000954	TAA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000954	AGA	2	6	4710	4715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000954	TTA	2	6	4781	4786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000954	TCAT	2	8	4857	4864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_000954	AGG	2	6	4881	4886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000954	CTA	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_000954	A	7	7	4968	4974	100 %	0 %	0 %	0 %	11497326
107	NC_000954	GAA	3	9	4997	5005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497326
108	NC_000954	TTAC	2	8	5165	5172	25 %	50 %	0 %	25 %	11497326
109	NC_000954	GTT	2	6	5210	5215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497326
110	NC_000954	GAATTT	2	12	5219	5230	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11497326
111	NC_000954	A	6	6	5240	5245	100 %	0 %	0 %	0 %	11497326
112	NC_000954	TGAACT	2	12	5257	5268	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497326
113	NC_000954	ATT	2	6	5271	5276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497326
114	NC_000954	TAG	2	6	5281	5286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497326
115	NC_000954	GAA	2	6	5297	5302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497326
116	NC_000954	G	6	6	5311	5316	0 %	0 %	100 %	0 %	11497326
117	NC_000954	TG	3	6	5396	5401	0 %	50 %	50 %	0 %	11497326
118	NC_000954	AATG	2	8	5412	5419	50 %	25 %	25 %	0 %	11497326
119	NC_000954	TGT	2	6	5505	5510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556547
120	NC_000954	TTC	2	6	5526	5531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556547
121	NC_000954	AG	3	6	5537	5542	50 %	0 %	50 %	0 %	364556547
122	NC_000954	TTA	2	6	5579	5584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556547
123	NC_000954	TGG	2	6	5828	5833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497328
124	NC_000954	TAG	2	6	5909	5914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497328
125	NC_000954	AT	3	6	5930	5935	50 %	50 %	0 %	0 %	11497328
126	NC_000954	AAT	2	6	5937	5942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497328
127	NC_000954	TA	3	6	5946	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	11497328
128	NC_000954	CTA	2	6	6030	6035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497328
129	NC_000954	AAGT	2	8	6077	6084	50 %	25 %	25 %	0 %	11497328
130	NC_000954	GCA	2	6	6105	6110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497328
131	NC_000954	TTG	2	6	6118	6123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497328
132	NC_000954	AAT	2	6	6245	6250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497329
133	NC_000954	ATC	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497329
134	NC_000954	GCT	2	6	6305	6310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497329
135	NC_000954	ATA	2	6	6320	6325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497329
136	NC_000954	AT	4	8	6422	6429	50 %	50 %	0 %	0 %	11497329
137	NC_000954	AT	3	6	6556	6561	50 %	50 %	0 %	0 %	11497329
138	NC_000954	TAA	2	6	6562	6567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497329
139	NC_000954	AGG	2	6	6702	6707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497329
140	NC_000954	TAG	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000954	ATT	2	6	6778	6783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000954	TGC	2	6	6833	6838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_000954	GAA	2	6	6984	6989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_000954	TCAA	2	8	12257	12264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
281	NC_000954	TA	3	6	12318	12323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_000954	AATCT	2	10	12351	12360	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
283	NC_000954	AAT	2	6	12387	12392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_000954	AAC	2	6	12410	12415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_000954	CA	3	6	12476	12481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
286	NC_000954	AGG	2	6	12482	12487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_000954	TAAT	2	8	12582	12589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_000954	AAT	2	6	12611	12616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497330
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